الأول ، فتقاطر الطلاب إليه ، وتحلَّقوا حوله يستزيدون من علومه ، ثم بعد ذلك حينما هاجر إلى النجف الأشرف عام 448 ه استمر فيها بالتدريس إلى حين وفاته ، فخلال هذه الفترة التي استمرت مدة ربع قرن تتلمذ على الشيخ مئات الطلاب ، لكننا لم نعثر على أسمائهم في كتب التراجم والرّجال إلَّا قلة قليلة لا تتعدى أسماء ثلاثين أو أربعين من مشاهيرهم ، وهؤلاء ينقسمون ، إلى ثلاثة أقسام : قسمٌ يعدّون من طلابه ببغداد ، وآخرون في النجف الأشرف ، وقسم ثالث يُشك في تلمذتهم على الشيخ نفسه ولعل بعضهم تتلمذ على ولده الشيخ أبو علي الحسن بن محمد بن الحسن الطوسي . وإليك أسماؤهم : القسم الأوّل : 1 - آدم بن يونس بن أبي المهاجر النَسَفي . 2 - أحمد بن الحسين بن أحمد النيسابوري ( ت 480 ه ) 3 - إسحاق بن محمد بن بابويه القُميّ 4 - إسماعيل بن محمد بن الحسن بن بابويه القميّ ( ت 500 ه ) 5 - بركة بن محمد بن بركة الأسدي 6 - تقي بن نجم الحلبي المكنّى بأبي الصلاح الحلبيّ ( ت 447 ه ) 7 - جعفر بن علي بن جعفر الحسيني 8 - الحسن بن عبد العزيز بن الجبهاني 9 - الحسن بن محمد بن الحسن الطوسي ( توفي حدود سنة 515 - 511 ه ) 10 - السيد ذو الفقار بن محمد بن معبد الحسيني المروزي